Tercera temporada de Aria. En el siglo 24 en el planeta Aqua, tres chicas, Akari Mizunashi, Alice Carroll y Aika S. Granzchesta, continúan trabajando duro para lograr su objetivo de convertirse en Prima Undines: gondoleros guías turísticos profesionales. Afortunadamente, las chicas cuentan con la guía de las tres mejores Prima Undines en Neo-Venezia: Alicia Florence, Athena Glory y Akira E. Ferrari, quienes son conocidas como las "Hadas del agua" en honor a su habilidad. Con su ayuda, las jóvenes aprendices entrenan duro y trabajan para superar cualquier situación en la que se encuentren.
Aria The Origination sigue las dificultades y la vida cotidiana de estas tres jóvenes, que están haciendo todo lo posible para mejorar como gondoleros de gira en Neo-Venezia, una réplica terraformada de Venecia.